在万方查重系统中，通常会根据用户提交的文档数量来收取费用。一般来说，随着提交次数的增加，查重费用也会相应增加。这是因为系统需要消耗更多的资源来处理更多的文档，因此会对提交次数进行计费。同时，一些机构还会根据提交文档的篇数或字数来制定不同的收费标准，用户在使用万方查重服务时需要根据自身需求选择合适的套餐。

另外，在提交次数较多的情况下，一些机构也会提供一定的折扣或优惠活动，以鼓励用户多次提交文档。因此，用户在使用万方查重服务时，可以关注平台的活动信息，选择在合适的时间提交文档，以获得更优惠的费用。同时，也建议用户根据自身需求和预算，合理安排提交次数，以达到经济高效利用服务的目的。